Vedení společnosti Krka spoléhá na odhodlání, odpovědnost a jasnou vizi, tak aby vedla zaměstnance k plnění cílů a poslání společnosti. Složité podnikové procesy jsou řešeny transparentně, což vyžaduje úzkou a intenzivní spolupráci zaměstnanců.

Korporátní řízení společnosti Krka je založeno na dvoustupňovém systému. Společnost řídí představenstvo, přičemž její činnost kontroluje dozorčí rada. Správa a řízení společnosti vychází z právních předpisů Slovinské republiky, slovinské a mezinárodní dobré praxe, veřejně dostupné Politiky správy a řízení společnosti a jejích vnitřních předpisů.